SARS-CoV-2: Betapa Seriusnya varian B.1.1.529, kini dinamakan Omicron

Varian B.1.1.529 pertama kali dilaporkan kepada WHO dari Afrika Selatan pada 24^th November 2021. Jangkitan B.1.1.529 pertama yang disahkan adalah daripada spesimen yang dikumpul pada 9^th November 2021¹. Sumber lain² menunjukkan bahawa varian ini mula-mula dikesan dalam sampel yang dikumpul pada 11^th November 2021 di Botswana dan pada 14^th November 2021 di Afrika Selatan. Sejak itu, jumlah kes COVID-19 telah meningkat dengan mendadak di hampir semua wilayah di Afrika Selatan. Pada 27^th November 2021, kes baharu varian ini juga telah dilaporkan di Belgium, Hong Kong, Israel, United Kingdom³, Jerman, Itali dan Republik Czech yang semuanya berkaitan dengan perjalanan asal.  

Terima kasih kepada pihak berkuasa Afrika Selatan kerana tidak meluangkan masa dalam berkomunikasi dan berkongsi maklumat yang relevan dengan komuniti saintifik global supaya kumpulan pakar WHO dapat bertemu pada 26^th November 2021 dan segera menetapkan varian ini sebagai Varian kebimbangan (VOC). Keseriusan perkara itu boleh diukur daripada fakta bahawa B.1.1.529 telah ditetapkan sebagai varian dalam pemantauan (VUM) hanya dua hari lalu pada 24^th November 2021 sebelum dilantik sebagai VOC pada 26^th November 2021 tanpa ditetapkan terlebih dahulu sebagai varian dalam siasatan (VOI).  

Jadual: Varian kebimbangan (VOC) SARS-CoV-2 pada 26 November 2021 

Kesegeraan dalam menetapkan B.1.1.529 sebagai varian kebimbangan (VOC) adalah wajar kerana didapati varian ini adalah varian SARS-CoV-2 yang paling berbeza setakat ini. Berbanding dengan virus SARS-CoV-2 yang pada asalnya dikesan di Wuhan, China, ini mempunyai sebanyak 30 perubahan asid amino, 3 pemadaman kecil dan 1 sisipan kecil dalam protein spike. Daripada perubahan ini, 15 terletak dalam domain pengikat reseptor (RBD), bahagian virus yang membolehkannya masuk ke dalam sel manusia, yang membawa kepada jangkitan. Varian ini juga mempunyai beberapa perubahan dan pemadaman di kawasan genomik lain². Mutasinya sangat meluas sehinggakan seseorang boleh memanggilnya strain baru, bukannya varian. Jumlah mutasi spike yang sangat tinggi bermakna peningkatan kemungkinan melarikan diri daripada antibodi yang diketahui yang menjadikan varian ini satu perkara yang membimbangkan.⁵.  

Menukar kepada varian baharu adalah perkara biasa bagi coronavirus. Sudah menjadi lumrah bagi coronavirus untuk mengalami mutasi dalam genomnya pada kadar yang sangat tinggi, disebabkan kekurangan aktiviti nuklease pembacaan pruf polimerasenya; lebih banyak penghantaran, lebih banyak ralat replikasi dan oleh itu lebih banyak mutasi terkumpul dalam genom, membawa kepada varian baharu. Koronavirus manusia telah membina mutasi untuk mencipta varian baharu dalam sejarah baru-baru ini. Terdapat beberapa varian yang bertanggungjawab untuk wabak sejak 1966, apabila episod pertama dirakam⁶. Tetapi, mengapa mutasi yang begitu meluas dalam satu letusan? Mungkin, kerana varian B.1.1.529 berkembang semasa jangkitan kronik orang yang lemah imun, mungkin pesakit HIV/AIDS yang tidak dirawat⁷.  

Walau apa pun punca mutasi yang meluas, jika kadar pantas ia merebak di Afrika Selatan adalah sebarang petunjuk, evolusi varian ini mungkin mempunyai kesan yang besar pada imuniti, kebolehtransmisian & virulensi dan keberkesanan vaksin sedia ada, yang sedang digunakan.  

Sama ada vaksin sedia ada akan kekal berkesan terhadap varian baharu ini atau jika terdapat lebih banyak kejadian jangkitan terobosan vaksin, terdapat sedikit data yang tersedia pada masa ini untuk membuat sebarang kesimpulan. Walau bagaimanapun, dalam kajian baru-baru ini, varian sintetik dengan 20 mutasi dalam protein spike telah menunjukkan pelepasan hampir lengkap daripada antibodi.⁷. Ini menunjukkan bahawa varian baru B.1.1.529 dengan mutasi yang jauh lebih meningkat, mungkin menunjukkan peneutralan yang berkurangan dengan ketara oleh antibodi. Varian baharu itu, bagaimanapun, nampaknya lebih mudah ditularkan mengikut kadar yang pantas di mana ia telah menggantikan varian Delta di Afrika Selatan, walaupun data semasa tidak mencukupi untuk membuat anggaran yang boleh dipercayai. Begitu juga, tidak mungkin untuk mengulas tentang keterukan gejala pada peringkat ini.  

Memandangkan fakta bahawa Eropah sudah pun dilanda kes COVID 19 yang luar biasa tinggi (disebabkan oleh varian delta yang sangat mudah ditularkan) sejak beberapa minggu lalu dan kadar yang pantas. Omicron (B.1.1.529) varian telah tersebar di Afrika Selatan baru-baru ini menggantikan varian delta, beberapa negara di Eropah termasuk UK, Jerman dan Itali telah mengenakan sekatan perjalanan ke atas ketibaan dari Afrika Selatan dan dari negara jiran seperti Botswana, Malawi, Mozambique, Zambia dan Angola. Takut yang paling teruk, Israel akan melarang kemasukan pelawat dari semua negara.  

Dunia telah melabur begitu banyak dalam membangunkan dan mentadbir vaksin COVID-19 untuk melindungi orang ramai daripada wabak itu. Persoalan yang paling penting dalam fikiran saintis dan pihak berkuasa adalah sama ada vaksin COVID-19 utama seperti Pfizer–BioNTech, Oxford–AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson akan kekal berkesan terhadap varian Omicron (B.1.1.529) juga . Ini didorong oleh fakta bahawa jangkitan terobosan telah dilaporkan di Afrika Selatan. Kedua-dua kes Hong Kong itu juga telah menerima dos vaksin⁹. 

Pembangunan vaksin "pan-coronavirus".¹⁰ (platform vaksin berbilang¹¹) nampaknya keperluan masa itu. Tetapi, lebih cepat, adalah mungkin untuk mengeluarkan dos penggalak vaksin mRNA dan DNA yang meliputi mutasi dengan cepat. Di samping itu, baru-baru ini diluluskan antivirus (Merck's Molnupiravir dan Pfizer's Paxlovid) sepatutnya berguna dalam melindungi orang ramai daripada dimasukkan ke hospital dan kematian.   

 *** 

Rujukan:  

1. WHO 2021. Berita – Klasifikasi Omicron (B.1.1.529): Varian Kebimbangan SARS-CoV-2. Diterbitkan pada 26 November 2021. Tersedia dalam talian di https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. Pusat Pencegahan dan Kawalan Penyakit Eropah. Implikasi kemunculan dan penyebaran SARSCoV-2 B.1.1. 529 varian kebimbangan (Omicron), untuk EU/EEA. 26 November 2021. ECDC: Stockholm; 2021. Boleh didapati dalam talian di https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. Kerajaan UK 2021. Siaran akhbar – Kes pertama UK bagi varian Omicron dikenal pasti. Diterbitkan pada 27 November 2021. Tersedia di https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. WHO, 2021. Menjejaki varian SARS-CoV-2. Boleh didapati dalam talian di https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Thomas Peacock: B.1.1 keturunan yang dikaitkan dengan Afrika Selatan dengan bilangan mutasi Spike #343 yang tinggi. Boleh didapati dalam talian di https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Prasad U.2021. Varian Coronavirus: Apa yang Kami Tahu Setakat ini. Eropah saintifik. Disiarkan pada 12 Julai 2021. Boleh didapati dalam talian di http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Kerja vaksin – Apakah yang kita tahu tentang varian coronavirus B.1.1.529 baharu dan patutkah kita bimbang? Boleh didapati di https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. et al. Halangan genetik yang tinggi terhadap pelarian antibodi peneutral poliklonal SARS-CoV-2. Alam Semula Jadi (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. Varian coronavirus yang sangat bermutasi membuatkan saintis berjaga-jaga. alam semula jadi News. Dikemas kini 27 November 2021. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Soni R. 2021. Vaksin "Pan-coronavirus": RNA Polymerase Muncul sebagai Sasaran Vaksin. Eropah saintifik. Diterbitkan pada 16 November 2021. Tersedia di http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Siaran berita – NIAID mengeluarkan anugerah baharu untuk membiayai vaksin “pan-coronavirus”. Disiarkan pada 28 September 2021. Boleh didapati di https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

***